Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC4Q9NPP4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC4Q9NPP4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms