Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VTA1Q9NP79 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTA1Q9NP79 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms