Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFT1Q9NNX1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFT1Q9NNX1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms