Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRMS1Q9HCU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms