Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM27Q9HBJ8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM27Q9HBJ8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms