Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF41Q9H4P4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms