Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms