Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC8Q9H0W5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms