Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP44Q9H0E7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP44Q9H0E7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms