Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP44Q9C0F1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms