Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RNF17Q9BXT8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF17Q9BXT8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms