Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD1Q9BXT4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms