Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R3Q9BXE9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms