Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP9Q99956 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms