Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN18Q99952 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms