Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP2Q96SN8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms