Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPR78Q96P69 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPR78Q96P69 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms