Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC7Q96NW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC7Q96NW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms