Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E2Q96LR5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms