Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EP400Q96L91 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EP400Q96L91 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms