Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms