Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms