Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEIL1Q96FI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms