Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF3Q92576 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF3Q92576 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms