Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECAB1Q8N987 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAB1Q8N987 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms