Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms