Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD2Q8IZ73 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms