Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLD3Q8IV08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLD3Q8IV08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms