Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIBP1Q86W92 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIBP1Q86W92 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms