Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2Q1Q7Z7E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms