Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SSH2Q76I76 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH2Q76I76 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms