Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TMEM179Q6ZVK1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM179Q6ZVK1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms