Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf39Q6ZRI6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf39Q6ZRI6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms