Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms