Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC171Q6TFL3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms