Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL35Q6PF15 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms