Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40Q6AI12 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms