Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms