Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms