Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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