Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOCADQ5VW36 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms