Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP350Q5VT06 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms