Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDSS1Q5T2R2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms