Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC158Q5M9N0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms