Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COLEC12Q5KU26 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms