Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms