Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRNQ4KMQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRNQ4KMQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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