Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF1Q3BBV0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms