Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TWISTNBQ3B726 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms