Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPP1Q1MSJ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSPP1Q1MSJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms